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泰媒近日报道泰国医学厅厅长透露,泰国在新冠病例中检测出“德尔塔克戎”XAY.2毒株。泰媒称,XAY.2毒株是德尔塔亚型AY.45和奥密克戎亚型BA.4/5重组而成的变种。通过基因测序,法国科学家证实了“德尔塔克戎”变体的存在。此前,“德尔塔克戎”已在丹麦、荷兰等多国发现了“德尔塔克戎”相关病例。目前全球已发现344例病例,但尚未发现有密切接触者感染。
去年六月份南非监测到两簇Delta和Omicron的重组集群,它们含有几个值得关注的S蛋白的点突变。这两簇重组集群的S蛋白和 BA.4/5共享的点突变有L18F, T19R, W152L, E156del, F157del, R158G, F186L, G446D, T1117I。
区别omicron的点突变:第一簇有 R21G, F486P, P621S, A706V;第二簇有S477D。
两个重组集群在L452R的位置都有第二种突变,但BA.4/5没有。去年八月份,南非关注到了包含F486P的这个重组突变集群,正式将其描述为Delta-Omicron重组体,命名为XAY,并进行基因组监测。
南非的BA.2后代竞争过程中,BA.4/5分支胜出,其它的分支都没占优势,包括最早提到的XD。XAY较XD后来出现,也没有占优势,它的几个兄弟XAW/XBA/XBC也都没有优势。而XBB在它们后面出现,是Omicron自己后代的重组,已经在好几个国家优势凸显。
说回XAY,它的重组融合位点是Delta S蛋白的一小段N端和更小一段C端,中间大部分是BA.2的序列。前面的融合位点可能发生在RBD区域,具体我也没做比对。
从南非的基因组监测数据统计图来看,肉眼基本看不到XAY占的比例,它的优势一点都不突出(下面图例已用红色箭头指示)。
能纳入监测可能是因为对Delta-Omicron的重组感兴趣,因为亲本各有值得关注的特点。
XBB最新的死亡数据
近全球新冠疫情出现了新的变化,病死人数持续增高;最近两周的单日新冠病死人数比之前增长43%,而新增病例数并没有太大变化、还稍有降低。
这种情况在美国尤为明显,不管是以XBB.1.5为主流毒株还是非主流毒株的地区,都出现了新冠住院人数的大幅增长。
1、全球新增病死人数明显增高
最近两周全球单日新增病例较前降低19%,全球平均每天新增41万病例。
每天新增病死人数较前增高41%,达2,409人。需要说明的是,约翰·霍普金斯大学的数据中心,采集的数据来源均为各国权威部门发布的数据。
单周病例数和病死人数最多的国家:从最近1周新增病例绝对数看,日本单日确诊病例最多,单日新增超过16万人;其次是美国、韩国、巴西和德国等。1月14日,从新增病例绝对数看,日本单日确诊病例最多。从最近1周新增病死人数看,美国单日病死的新冠病例最多;其次是日本、德国、泰国和英国等。
2、日本的新冠单日病死人数突破历史最高
我一直关注日本的疫情管控;日本“低感染率、低超额死亡”的成功经验也受到全球瞩目。根据数据世界的统计,可以发现日本的新冠病死情况目前有几个特殊之处:
A,日本最后一波疫情导致的单日病死人数峰值超过之前BA.4/5时的历史记录。
B,与完全放开的欧美国家病死人数越来越少不同,日本的几波大的疫情中,病死人数越来越多。
这种特殊情况,与日本一直未有全面爆发的疫情相关;也就是日本出现的一波波疫情,主要不是再次感染、而是未感染人群被感染。
(日本的新冠单日病死人数达历史新高)
3、美国的疫情变化
美国在Omicron疫情初期的前三个月,即有50%的人感染了Omicron,加上之前的感染人群,以及一波波Omicron亚型掀起的小波浪,到2022年11月,美国民众已有94%感染过新冠病毒。也就是说,绝大多数美国民众,已经是新冠幸存者;新冠病毒其造成的伤害也更弱。哈佛等最新报告:美国94%人口感染过新冠病毒
二价mRNA疫苗接种后死亡及重症率的比较
目前,全球范围内,接种的新冠疫苗主要分为五类:灭活疫苗(以科兴、国药为代表),重组蛋白疫苗(以智飞龙科马为代表),腺病毒载体疫苗(以强生、阿斯利康为代表),mRNA疫苗(以辉瑞、莫德纳为代表)和DNA疫苗(以基达斯为代表)。
相比于灭活疫苗等传统技术开发的疫苗,新兴的mRNA疫苗凭借研发周期短和保护率高的优点,在新冠流行期间迅速投入临床运用。其中,辉瑞开发的新冠mRNA疫苗(BNT162b2)于2020年12月首次获取FDA紧急使用授权,2021年8月正式获批上市,目前接种人数达到数亿,是全球接种人数最多的疫苗之一。
美国是率先启动包含有Omicron突变株抗原二价疫苗接种的国家之一,且美国CDC定期公布不同疫苗接种情况的病死率。
所以我们一直关注着美国的COVID-19病死数据。
(美国不同疫苗接种情况、不同年龄组的新冠病死率)
(美国新冠疫情。图源:纽约时报新冠追踪器)
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美国CDC数据显示:
二价疫苗接种组在80岁以下年龄组中新冠病死率极低(0.00%);但80岁及以上老年组的新冠病死率仍为1.01%。
已经接种过疫苗、但未接种二价疫苗的人群中,18-29岁组病死率为0.00%,30-49岁组为0.01%,50-64岁组为0.12%,65-79岁组为0.59%;80岁及以上年龄组为3.17%。
未接种疫苗的人群中,18-29岁组病死率为0.00%,30-49岁组为0.11%,50-64岁组为0.42%,65-79岁组为5.51%;80岁及以上年龄组为14.46%!
尽管这种数据仍未经过既往感染史、年龄、基础疾病、Paxlovid用药等的匹配,但接种二价疫苗能够大幅降低新冠感染病死风险已经非常非常明显;尤其是二价疫苗接种组在80岁以下年龄组降低到了罕见(0.00%)的病死。
曹云龙团队:即使完成三剂灭活疫苗接种仍不能有效中和XBB.1和XBB.1.5
下图是北大曹云龙团队发布在cell research上的论文,源于2022年初天津的感染数据,奥密克戎BA1毒株。轻症占了47.7%,普通型50.2%,重症0.5%。咳嗽和发烧是最主要的症状。所有阳性感染者中只有1.6%是无症状感染者。
曹云龙团队的最新研究显示,Omicron XBB.1.5的传染性极强,有必要未雨绸缪,接种更高保护力的疫苗。
结果指出:即使完成三剂灭活疫苗接种,发生BA.1或BA.5或BF.7突破感染的康复期血清仍不能有效中和XBB.1和XBB.1.5;提示即使突破性感染这些毒株也无法保证有效预防未来新变异株的重复感染。
康希诺入式疫苗加强第四剂
2022年9月6日,Nature杂志特意以“How nasal-spray vaccines could change the pandemic”(鼻喷疫苗将如何改变新冠大流行)的题目发文,认为通过嘴或鼻吸入疫苗的方式接种,可能会阻止新冠病毒的传播。
中国康希诺公司研发的吸入型COVID-19疫苗在中国获得新冠加强针的紧急使用授权,指出:从理论上讲,经口或者经鼻的吸入型疫苗将启动这些部分的黏膜免疫,从而在病毒进入人体时就快速阻止病毒的进一步入侵。面对新冠病毒,传统疫苗越来越不行的一个重要原因是:肌注接种的方式。肌肉注射接种能够诱导出很强的全身免疫应答,以IgG抗体为主、并存在于循环系统中。
但问题是,
1,存在于循环中的抗新冠病毒IgG抗体会快速衰减;
2,新冠病毒却在快速进化,尤其是Omicron突变株表现出更强的嗜上呼吸道特性。
也就是,IgG在循环系统中,水平越来越低,很快就无力分布到口鼻咽喉黏膜等末梢部位,也就无法起到预防感染的作用;而Omicron病毒却较前更强地通过口鼻咽喉等部位入侵到人体。此消彼长,肌注疫苗越来越力不从心。
吸入型疫苗则不同,既可以诱导遍布到全身的IgG抗体为主的免疫应答、更擅长于诱导口鼻咽喉部位的局部IgA抗体为主的免疫应答,从而充当感染部位的哨兵、并更快地采取行动。
正如美国知名病毒学家、耶鲁大学免疫学教授、Howard Hughes医学研究所首席科学家Akiko Iwasaki博士在Sci Immunol发文,题目即为“Operation Nasal Vaccine-Lightning speed to counter COVID-19”(鼻疫苗,以闪电般速度对抗COVID-19)。
Nature的这篇文章也介绍了康希诺新获批的这个吸入型新冠加强针的使用:该疫苗针对黏膜免疫研发,成分与肌注疫苗一样、但剂量只是肌注疫苗的1/5;使用时,通过喷雾器从嘴里吸入,以液体或者液滴形式附着在黏膜组织,诱导黏膜免疫。
疫苗的一些看法
最近更多朋友在后台留言分享自己的信息:2022年1月6日起,复星医药开始为中国香港地区的私营医疗体系供应复必泰二价疫苗,有需要人士可在提供复必泰二价疫苗的诊所或医疗机构进行自费接种。同日,复星健康平台也正式开启赴港接种预约服务,并与京东健康、美团、阿里健康、百度健康、微医等平台陆续开展合作,以方便有需求的用户通过这些平台进行线上预约。
mRNA疫苗无疑代表了疫苗研发的顶级科技:mRNA疫苗最大的优点之一就是快速适应病毒变种,新冠突变株中核苷酸发生改变,那么在生产mRNA疫苗的过程中,可以直接把这个核苷酸修正过来,改为突变株的,下游的生产通路几乎没有大的变化。这种效率要远远高于其他技术。其次是安全,不需要真的病毒注入体内,没有染病的风险。
对于吸入式疫苗简单来说,优势是黏膜免疫,不痛;作为加强针,中和抗体水平高于现有灭活或重组蛋白加强,但低于mRNA疫苗(国产mRNA疫苗已经在印尼EUA);同时需要特殊设备以及对医务人员重新培训,而且是基于原始毒株,对奥密克戎防护力一般。
所以综合来看比较理想的方式是接种二价mRNA疫苗和吸入式腺病毒载体新冠疫苗,吸入式疫苗相对过敏反应会大,毕竟是通过病毒载体实现,个人根据自身体质斟酌。
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